DU création, analyse et valorisation de données biologiques omiques par Université Paris Diderot

La formation s'articule autour de 10 sessions de 2 jours réparties sur une année civile organisée comme suit :
Jour 1 : 6h de cours et de travaux pratiques + 1h de travail en autonomie à l'université
Jour 2 : 3h de cours et de travaux pratiques + 4h de travail en autonomie à l'université
Entre les sessions : 4h de travail distanciel. Cela représente au total 90 h de cours/TP et 90 h de mise en situation avec suivi pédagogique. Les cours/TP bénéficieront d'un triple encadrement et seront organisés autour de séquences de cours théoriques relativement courtes, pour laisser une large place à l'aide à la réalisation pratique. L'enseignement est organisé en 6 modules fonctionnant de manière transverse et continue, de façon à reproduire la démarche d'un laboratoire de recherche.
L'enseignement est organisé en 6 modules :
-Plan d'expérience et génération de données
- omiques / 18h / B. Cosson
Réflexions sur le plan d'expérience et les méthodes de génération de données
- omiques
-Gestion de données expérimentales et reproductibilité des analyses / 18h / B. Cosson, G. Lelandais & P. Poulain
Sensibilisation à la gestion de données et à la reproductibilité des analyses
-Outils statistiques / 18h / G. Lelandais
Compréhension des outils statistiques indispensables à l'analyse des données
- omiques
-Automatisation du processus d'analyse de données / 18h / P. Poulain
Automatisation du processus d'analyse de données (création de workflows)
-Présentation et valorisation des résultats pour publication / 18h / P. Poulain, G. Lelandais & B. Cosson
Méthodes de représentation de données, outils logiciels associés
-Mise en situation et projet / 90h / B. Cosson, G. Lelandais & P. Poulain
Exercices pratiques et mise en application des compétences acquises dans un projet personnel.

Ce diplôme universitaire offre la possibilité d'acquérir une expertise en analyse omique (génomique, transcriptomique, protéomique) avec un objectif opérationnel. Elle est conçue pour développer et renforcer des compétences en création, analyse et valorisation de données expérimentales haut débit, permettant au stagiaire de renforcer une équipe scientifique ou un service pour une mission d'analyse de données omiques.
À l'issue de la formation, le professionnel est capable de :
-Définir un plan d'expérience et choisir le(s) méthode(s) de génération de données omiques adéquates
-Gérer des données pertinentes et garantir la reproductibilité de ses analyses
-Appliquer les outils statistiques adaptés à l'analyse des données expérimentales
-Automatiser le processus d'analyse de données (workflows d'analyse)
-Présenter et valoriser les résultats.