DU séquençage haut débit par UNIVERSITE DE BOURGOGNE - SERVICE COMMUN DE FORMATIONS CONTINUE ET PAR ALTERNANCE (SEFCA)

Le volume horaire de ce diplôme est de 105 heures, réparties sur 5 modules de 21 heures (sur 3 jours) :

Module 1 :
Séquençage nouvelle génération
- Technologies et applications (théorique).Module
2 : Introduction à Linux et à la programmation (pratique).
Module 3 : Analyse de
données de séquençage haut débit (pratique).
Module 4 : Bases de données, outils
de prédiction in silico et analyses approfondies (pratique et théorique).Module
5 : Séquençage haut débit et diagnostic
- Exemples d'applications, qualité,
rendu des résultats et considérations éthiques (théorique).

Cette formation vous permet :D'acquérir une formation en séquençage
haut débit appliqué aux maladies génétiques mendéliennes, des technologies de
séquençage et approches expérimentales possibles aux outils bioinformatiques
utilisés pour le traitement des données brutes, l'identification de variations
génétiques et l'interprétation des résultats.De se familiariser avec le système
Unix/Linux, la ligne de commande et la gestion et l'analyse de données sur un
serveur à distance.De connaitre et savoir utiliser les
principaux logiciels dédiés à l'analyse de données de séquençage haut débit, de
l'alignement des séquences brutes à l'annotation de variations génétiquesDe maîtriser les principaux navigateurs,
bases de données et outils de prédiction couramment utilisés en génétique
humaine et médicale.De connaître les différentes
applications possibles du séquençage haut débit pour le diagnostic de maladies
génétiques, les principales règles à suivre et paramètres à considérer pour
assurer la qualité des données produites dans un contexte de laboratoire
médical, et les considérations éthiques que soulève le séquençage haut débit
pour l'interprétation et le rendu des résultats.